A oficial Jeny recebeu informações de que a Equipe Rocket está de volta à sua antiga base após relatos da aparição de um Melmetal por lá.
Ao falar com ela na entrada da base, ao Noroeste de Pallet, ela pedirá para você entrar na torre e derrotar os capangas do Giovanni e impedir que eles tenham posse desse ser mítico.
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No início da torre estará o Ecbert. Falando com ele você poderá entrar na torre e iniciar os combates contra os Rocket. Com ele você também poderá visualizar o Ranking Quinzenal. O Top 3 quinzenal receberá Outfit única e Badges temporárias.
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Em cada andar da torre um Rocket irá surgir. A medida que você avança, maior o nível e mais forte serão os pokémons deles. Você poderá sair sempre que quiser que não irá perder o progresso da torre. Seu progresso apenas será resetado quando perder a batalha.
Ao vencer cada duelo o jogador terá a chance de achar a Meltan Key. 
A Meltan Key servirá para abrir uma Raid especial dos Melmetal onde os jogadores terão a chance de capturar esse pokémon mítico.
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A cada 5 andares você receberá uma quantidade de Tokens. A quantidade irá aumentar de acordo com o avanço. Esses Tokens poderão ser trocados por itens na loja da Oficial Jeny.
Os jogadores que chegarem no 100º andar receberão uma Outfit exclusiva da Torre.
Sempre que vencer uma batalha irá surgir um Pokémon Sombroso (shadow). Esses pokémons terão uma aura e título especiais. Quando purificado terão seus IV’s melhorados em +3. Sua taxa de captura é aleatória e não influencia na pontuação de captura atual de sua respectiva espécie.
Loja
Você poderá acessar a Loja com a oficial Jeny. Lá poderá trocar seus Tokens por itens especiais.
Um deles é o Scary Candy. Este item irá ajudar a encontrar as formas sombrosas dos pokémons Fennikin, Chespin e Froakie.
A loja também contará com itens cosméticos (Outfits e Locker), de aumento de força (vitaminas, doce raro e ticket’s), TM’s e Egg/Ability Capsule.
